Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp1P58466 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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