Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh3bp1P55194 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms