Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aqp4P55088 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Aqp4P55088 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms