Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcnfP51944 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms