Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CntfP51642 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CntfP51642 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CntfP51642 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CntfP51642 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfP51642 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms