Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa6P50704 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Defa6P50704 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms