Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VdrP48281 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VdrP48281 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VdrP48281 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VdrP48281 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms