Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf4P43488 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf4P43488 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms