Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PtprkP35822 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprkP35822 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PtprkP35822 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PtprkP35822 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PtprkP35822 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprkP35822 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PtprkP35822 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PtprkP35822 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms