Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Thbs1P35441 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Thbs1P35441 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thbs1P35441 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Thbs1P35441 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs1P35441 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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