Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Znf239P24399 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf239P24399 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms