Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TP20293 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TP20293 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TP20293 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TP20293 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TP20293 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TP20293 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TP20293 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TP20293 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TP20293 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TP20293 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms