Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf1P15314 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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