Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CatspereP0DP43 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CatspereP0DP43 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms