Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrnb1P09690 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms