Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa4P06728 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms