Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04214 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04214 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04214 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P04214 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P04214 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P04214 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P04214 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P04214 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P04214 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms