Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P04213 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P04213 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P04213 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P04213 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P04213 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P04213 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms