Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xirp1O70373 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms