Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1bO55017 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1bO55017 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms