Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CrxO54751 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CrxO54751 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CrxO54751 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CrxO54751 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CrxO54751 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CrxO54751 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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CrxO54751 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CrxO54751 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CrxO54751 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CrxO54751 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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