Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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