Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prrt1O35449 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prrt1O35449 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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