Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf5O35445 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf5O35445 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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