Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xbp1O35426 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xbp1O35426 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms