Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ncoa3O09000 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ncoa3O09000 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncoa3O09000 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms