Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3278L7N2D2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3278L7N2D2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms