Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm8356J3QPD3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm8356J3QPD3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm8356J3QPD3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm8356J3QPD3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm8356J3QPD3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm8356J3QPD3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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