Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21900J3QP38 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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