Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20828J3KMI7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20828J3KMI7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms