Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5798F7BTS7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm5798F7BTS7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Gm5798F7BTS7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm5798F7BTS7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5798F7BTS7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5798F7BTS7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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