Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10477F6SW83 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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