Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DspE9Q557 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DspE9Q557 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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