Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms