Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hfm1D3Z4R1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hfm1D3Z4R1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms