Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd1D3YXK1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd1D3YXK1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms