Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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BC048679D3YXE9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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BC048679D3YXE9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC048679D3YXE9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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