Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cttnbp2B9EJA2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms