Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf1bB9EJ57 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf1bB9EJ57 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms