Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clrn2B2RVW2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clrn2B2RVW2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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