Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms