Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Palm3A2TJV2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms