Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms