Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms