Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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HDAC11Q96DB2 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HDAC11Q96DB2 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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