Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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