Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm43836-201ENSMUST00000196532 381 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm42634-201ENSMUST00000197362 381 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm38236-201ENSMUST00000192661 3229 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 AC122397.1-201ENSMUST00000228650 2819 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Pabpc6-201ENSMUST00000057190 3208 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd11P23813 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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