Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms