Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms