Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim3Q9R1R2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms